中心建设并运营了“中国教育经费统计数据库”。该数据库依托全国教育经费统计信息系统，连续、系统地记录每一所学校的教育经济信息，学校类别涉及全部公立和民办学校，包括学前教育、义务教育、高中阶段、职业教育和高等教育（不含军事院校）的全部教育阶段。

该数据库的指标体系能全面反映全国各级各类学校基本办学情况（例如教职工人数、学生人数等事业指标）、学校收入与支出（例如财政性教育拨款、学费收入、其他事业收入、教师工资、学生资助、学校运转费用、固定资产投资）、学校资产与债务等重要指标，数据涵盖全国50余万个教育经费统计调查对象、300多个教育基本情况、教育经费收入、支出以及债务统计指标。